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構(gòu)建帶有UMT的Illumina NGS文庫

更新時間:2020-11-10 點擊次數(shù):1161

 

構(gòu)建帶有UMT(Unique Molecular Tags)的Illumina NGS文庫

ThruPLEX® Tag-seq Kit
· 可信賴的實驗結(jié)果。ThruPLEX Tag-seq 技術(shù)提供了多達(dá)1,600萬個分子標(biāo)簽來糾正測序誤差,
   提供可信的變異檢測分析。
· 發(fā)現(xiàn)更多,成本更低。結(jié)合基于雜交技術(shù)的目標(biāo)序列富集系統(tǒng)可分析數(shù)百個基因,同時分析突變和結(jié)構(gòu)變異。
· 每次都可獲得高質(zhì)量文庫。單管操作,2小時,3步操作流程。使用簡便,可減少使用者操作誤差和污染發(fā)生。
· 省時的生物信息學(xué)分析方案。采用Curio Genomics提供的云服務(wù)軟件或開源軟件可以快速獲得
   研究結(jié)果。
· 珍貴樣品分析成為可能。更低的DNA起始量,以往由于起始量太低而不能分析的樣品也可以分析了。
   ThruPLEX Tag-seq可以1 ng至50 ng cfDNA或片段化的dsDNA起始,兼容多種樣品類型。 
 
■ 產(chǎn)品說明:
ThruPLEX Tag-seq采用帶有特別分子標(biāo)簽(UMT)的ThruPLEX引物構(gòu)建帶有分子標(biāo)記和樣品檢索引物的Illumina NGS文庫。每個試劑盒包含超過1,600萬個特別序列用于在擴(kuò)增前標(biāo)記每條DNA小片段,可以在文庫制備、目標(biāo)富集和數(shù)據(jù)分析過程中追蹤DNA片段,以檢測低豐度等位基因或計數(shù)獨立片段。采用ThruPLEX 技術(shù)設(shè)計及優(yōu)化,可以1到50 ng DNA起始構(gòu)建高多樣性、高重復(fù)性文庫。整個流程在單管或單孔中就可完成,只需3步,2小時,無需中間純化步驟和樣品轉(zhuǎn)移,避免了操作誤差和樣品損失。ThruPLEX Tag-seq Kit 包含所需全部試劑,包括可以多重標(biāo)記96個樣品的檢索引物。純化和定量后,文庫可以采用標(biāo)準(zhǔn)Illumina測序試劑和流程在Illumina NGS平臺進(jìn)行測序。
 
圖1. 單管,三步操作流程。 ThruPLEX Tag-seq Kit以1-50 ng DNA起始構(gòu)建檢索引物文庫只需3步:末端修復(fù),接頭連接和高保真文庫擴(kuò)增。無需純化和樣品轉(zhuǎn)移步驟。簡化的工作流程,在單管或單孔中2個小時即可完成,避免樣品損失,增強了陽性識別。
 
圖2. ThruPLEX DNA-seq Kit技術(shù)概要。ThruPLEX技術(shù)以片段化雙鏈DNA或游離DNA起始,只需3步反應(yīng),簡單高效。
 
圖3. 減少背景,結(jié)果更可靠。以30 ng 1% Horizon cfDNA standard,采用 ThruPLEX Tag-seq構(gòu)建文庫。Agilent SureSelect富集目標(biāo)區(qū)域,~5,000X覆蓋度測序,采用Curio Genomics生物信息學(xué)平臺分析數(shù)據(jù)。采用原始數(shù)據(jù)分析,EGFR 的突變(黃色點)會被背景誤差遮蓋(左圖)。而在數(shù)據(jù)分析過程中使用UMT修正誤差,突變更容易識別(右圖)。 
 
圖4. 顯著提高信噪比,發(fā)現(xiàn)更多。以30 ng(A)或10 ng Horizon cfDNA standard采用ThruPLEX Tag-seq構(gòu)建文庫,240 KB定制panel(NimbleGen SeqCapEZ)富集目標(biāo)區(qū)域,HiSeq 2500 ~5,000X覆蓋度測序。Curio Genomics生物信息學(xué)分析平臺進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
*數(shù)據(jù)來源于Takara Bio Inc. 
 
■ 產(chǎn)品組成
· Template Preparation Buffer (Red)
· Template Preparation Enzyme (Red)
· Library Synthesis Buffer (Yellow)
· Library Synthesis Enzyme (Yellow)
· Library Amplification Buffer(Green)
· Library Amplification Enzyme(Green)
· Nuclease-Free Water(Clear)
· Indexing Reagent
 
■ 保存

-20℃

 

訂購信息

品牌貨號產(chǎn)品名稱產(chǎn)品規(guī)
TAKARAR400584ThruPLEX Tag-seq 6S(12)Kit12 Rxns
TAKARAR400585ThruPLEX Tag-seq 48S Kit48 Rxns
TAKARAR400586ThruPLEX Tag-seq 96D Kit96 Rxns 

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